ジム戦における個体値とCPの関係について

現在のCPが同じなら、技の優劣を考慮しない単純な強さはほぼ同等です。ただ今は同じでも今後その2匹を同じタイミングで強化し続けた場合、強化の回数を重ねるほどCP差は開いていき、最高評価と下から2番目評価なら最終的には評価差相応の差になるはずです。

端的に言えば、ほとんど変わらないようです。

同CPで個体値が違うということは、レベルが違うということ＝能力値にかかる「CP乗数」が変わるということです。そこで、CP乗数の差でどれだけ能力値に違いが出るのかを考えてみます。

簡単ではありますが、２体のカビゴンを例に、こちらの計算式を使って比較してみました（細かい過程は省略）：
https://pokemongo.gamepress.gg/pokemon-stats-advanced

１、CP2668　個体値100%　レベル30（CP乗数0.7317）
攻撃値＝143
防御値＝143
HP＝245

２、CP2660　個体値0％　レベル39（CP乗数0.78463697）
攻撃値＝141
防御値＝141
HP＝251

カビゴンのスタミナ種族値が高いので、乗数の差がHPにより大きく出ています。が、攻撃・防御でバランスが取れているので、実戦で違いが分かるほどの差にはならないと思います。

ただ傾向としては、尖った能力値を持つポケモンのほうが、レベル差（乗数の差）に影響されやすいようですね。

ＣＰは現在のステータス（攻撃力・防御力・ＨＰ）を元に計算されているので、ＣＰが同程度ということは現在の強さはほぼ同じと言うことができます。

【ＣＰの計算式】
攻撃力×（√防御力）×（√ＨＰ）÷10
※小数点以下切捨

この各パラメータは種族値、個体値、レベル係数（ＣＰ係数やＣＰ乗数とも言われる全ポケモン共通でレベルによって決まった数）で決まっており、質問者さんのナッシーは「個体値が低いけどレベルが高い個体」と「個体値が高いけどレべルが低い個体」で3パラメータの総合が同じくらいになっている状態です。

【各パラメータの計算式】
（種族値＋個体値）×レベル係数
※小数点以下切捨

なお、ＣＰの計算時は小数点以下切捨前の値を用いるため、ＣＰの計算式は2つの式を合わせて

（攻種＋攻個）×√（防種＋防個）×√（ＨＰ種＋ＨＰ個）×レベル係数^2÷10

とも表現されますが、意味合いとしては最初に示した式の方が分かりやすいと思います。

CPが同じ場合に個体値による優劣はあるのか？
→ないです。CP同じ場合は同じです。
　ただ、HPが異なる場合があるため、HPも同じか確認しましょう。