CP,HPの点数高とトレーナーの評価高、強化すべきポケモンはどっち？

そのコメントという事は青チームですね。
調べてもらうの評価ですが、誤差は測定誤差レベルで正確だと思います。

1のゲンガーは総合評価では最低評価（個体値48.9%以下/攻撃防御HPの合計が22以下）、ステータス個別で防御は最高評価という事は、防御は個体値15で最高ですから、後は相当低いという事ですよね。
合計が22以下で、防御は15確定ですから。
これはまず育てません。

2のゲンガーは総合評価で最高評価（個体値80.1%以上/攻撃防御HP合計が37以上）で攻撃と防御は最高評価で15ですから、HPは一番悪くても7です。
ただ、個体値は良いがレベルが低すぎるパターンです。
これも例え個体値が100で、理想技持ちでも育てません。
（カイリュー、ラプラス、カビゴン等なら一考しますが…）

ので個人的な意見としては、まずどちらも育てません。
僕は、まず育てる基準は、総合で最高評価かつレベルがたまご産の上限である20以上のものです。
進化後の個体を捕まえた場合は、よっぽど理想技を持っていて、レベルが高ければ育てる可能性は有りますが、極一部のポケモンのみです。
りゅうのいぶき持ちカイリュー、こおりのいぶきふぶきラプラス、したなめはかいカビゴン等です。
この辺りをCP2000超えで捕まえた場合は育てるかも知れません。（それでも、最低個体値60以上のもの）
要はレア度が高い上に、技厳選が大変で、更にジムの主力になるポケモンです。

話が逸れてしまいました。
今はハロウィン期間中なので、ゴースが腐るほど出ますので、ゲンガーが欲しい場合は期間中に、極力個体値が高く、レベルも高いゴースを何体も捕まえ、理想技持ちのゲンガーが出来るまで進化させるのが良いと思います。
（最低でも2のゲンガー位の評価で、出来るだけCPゲージが振っているゴース）
調べてもらうの評価を僕はとても重要視しています。

ただ僕個人の意見ですので参考程度にお考え下さい。

ジムで使うことを目的とするなら、リーダー評価（個体値）よりもCP、そしてCPよりも技のほうが重要だと思います。

評価の差は、実際のバトルではさほど大きな違いにはならないです。個体値にこだわって厳選しているポケモンのみ、気にすればいいかと。

ただ、ゲンガー自体はそれほどジムで役立つほうではないので… どのみち強化しないと思います。