最近・・・

正直、運営の意図しか感じません。

アップデートにしてもユーザーの意見は無視に近い状態で、続けさすための目標を作るためのものにしか感じません。
それでも中には相棒のアメ等ありがたいと感じる物もありますが、例えばラプラスのアメ5kmで１個と条件厳しく、目標有るけど達成難しいので長く続けて頑張ってくれ的な感じに受け取れます。
メダル獲得で捕獲率アップになりますが、メダル獲得の目標になるとは思いますが、捕獲率アップが体感できるかと言うと全く変わりません。
こちらのサイトに記載がある次回実装予定のデイリーボーナスについてもしかりです。
ラプラス等レアポケモンにしても地方では野生では影すら見ません。
人口多い地域でだすと噂になり、やっぱりでるのだと勘違いし頑張りますが出ないので孵化装置に走ると言った流れ。

自分も会社経営しておりますので、利益を得続けるための当然と言えば当然の処置と思いますが...........
ゲームとしては何とか運営の意図を感じさせない程度の対策をして頂かないと、操られている感ありありで、夢が無いとゆうかなんとゆうか。

恐らく次世代の実装が見えてくるようになると、個体値の低いストライクとかが出てくる様になるのでは無いでしょうか？

イーブイとサイホーンが良く出る事については単に地域性による物かと思います。
こちらでは以前からイーブイは良く出ており、今は進化させたい個体も無いためアメ２０００個以上たまっております。
サイホーンはぼちぼちな状態が変わりないです。

なんやかんや記載しましたが、ポケモンGO好きなので運営サイドには頑張って頂きたいです。

ご参考になれば幸いです。

最近ソースの変更がちょくちょくあるので、その影響かもしれませんね。うちの近所では、イーブイとサイホーンは以前からよく見かけるので、さほど変わったようには思いませんでした。

イーブイは新しいポケモンが追加される場合、進化素材として必要になる可能性大なので、よく獲れる時に良い個体を集めておいた方がいいかもしれません。

運営の意図といえば、最近チート対策に本腰を入れているようですね。APIスキャンが出来なくなったし、頻繁なソース改変もその一端かもしれません。次は、位置偽装の取り締まりが来るのではと期待しています。早くチーターを完全に取り除いて、ポケモンのトレード機能などを現実にしてほしいものです。

公式twitter（米国）で11/3に「ポッポとコラッタの出現率を下げ、他のポケモンの出現率を上げた（意訳）」と書かれています。

質問に書かれている「運営の意図」がどういった意味で書かれたのかよく分かりませんけど、よくあるただの調整だと思います。