ポケモンGOの回答詳細

個体値100を持っておらず80~90%台の妥協枠で実際にシャドウと通常を使っていた事が有りますが「通常技特化で使い捨てる」ならシャドウ、「必殺技を使う、シールドを使う」なら通常orリトレーン個体をオススメします。
大前提としてカイオーガは攻撃種族値は優秀ですが防御力はそこまで高くなく「必殺技の抱え落ち」をし易いです。
先に回答がある様に通常技のたきのぼりで削って行くのがメインウェポンになる為、個人的にはかみなりをオススメします。
水技の必殺技をオススメしない理由は1つめは通常技で既に追い込みが掛けれる為、相手が先に引く可能性がある事。2つめは対面互角を取られた際にかみなりの場合だと有利を取れる、シールドを奪える可能性が高いからです。
イメージ的にはシャドウカイオーガは「りゅういぶ型のシャドウカイリュー」高個体値の通常orリトレーン個体は「通常技あまえる/必殺技サイコショックのニンフィア」のような感覚です。
恐らくマスターリーグの事だと思うので蛇足になりますがハイパーリーグと仮定するとシャドウで運用するのであれば高個体値のシャドウドククラゲが攻防共に上位互換です。

カイオーガ軸は相手が草や電気に引いてきた際に、引き先や交代受け出来るポケモンにそこそこの耐久力が求められるのでキュレム、ディアルガ、ドリュウズ(通常)辺りとの組み合わせをオススメします。