レイド終了後にもらえる報酬は手持ちのアイテムが多いものが優先される？

あくまで体感ですが、完全否定です。レイドしかしませんので、バッグの中身は画像のような感じで常にほぼ一定です。レイド連戦する時はかなり頻繁に整理します。もちろん薬やかけらは15個とかもらうこともありますが、どちらかがゼロのこともあります。20戦、30戦と連戦すれば結局、1戦あたりの平均は薬9個、かけら9個、飴3個、技マシン1個、ぐらいかなと感じています。バンドルを8とした場合ですが、、

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それってただのオカルトでしょ。
パ○ンコで演出が良く来る台は当たりたがってるとか、激アツ外したら悪い台とか言ってるのと同じレベル。
全て確率に基づいて排出されてるんですよ。

単に印象に残りやすかっただけで偶然だと思います。

レイドでの報酬はその他にも金のズリの実もありますね。
私はボールや木の実を優先したいので不思議なアメはなるべく早く伝説のポケモンのアメに変えてしまい数個のことが多いですが、レイド報酬でのアメは出る時と出ない時のばらつきが結構ありますが平均すると3個程度は出ている気がします。
とはいえ元気のかけらや凄い傷薬などの回復アイテムが多いですけど。

凄い傷薬や元気のかけらはあまり持たないようにしていて、特にレイド連戦の時は1桁にしています。
満タンの薬が50～70個程度、元気の塊が100～130個程度、技マシンノーマルが50個前後、技マシンスペシャルは最近少し使って減ったのですが60個余りで多い時は80個程度です。

金ズリはあまり使わないこともあり意識しておらず気が付くと増えてしまい、エンテイと翌日のミュウツー連戦後には570個以上になっていました。今は減らしたのですがまだ520個ありますし、銀パイルとかと交換してほしいです。

バンドル概念を用いた説明がこちらにあります。
https://pokemongo.gamewith.jp/article/show/99245
バンドルと確率の組み合わせが基本だと思われます。

否定派です、まぁただ単にそんな「プログラム」をわざわざ組むのはめんどくさそうです。都市伝説として仲間内も含めて楽しめばいいんじゃないのでしょうか。このゲーム都市伝説が多すぎるので、すいませんあまり真剣には考えていません。ただこのような話も楽しんでいます。

偶然。

そう思うなら、自分やお仲間の情報を統計的に
集計してみては？信頼ある数字を出す為には、
お仲間の数が相当必要ですが。

小学生がゲームの攻略法で噂するレベル程度で
しょうね。