相棒から貰うお土産の意味は？

他の方も書かれているように、現在のところ使い道はありません。

相棒からのお土産は、ポケモンレッツゴー ピカチュウ/イーブイ（ピカブイ）からポケGOに輸入された要素ですが、「ちいさなはなたば」や「ビーだま」といったプレゼント限定アイテムはピカブイでも用途のない、記念品なので、ポケGOでも同様だろうと予想されています。

ただし、ピカブイでは「ハートのウロコ」や「ちいさなキノコ」（プレゼント限定ではなく、他の入手手段あり）といった使い道のあるアイテムを持ってきてくれる場合もあります。

このため、ポケGOでも将来的には、なんらかの使い道のあるアイテムがお土産として実装されることがあるかもしれません。

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現行仕様では何も出来そうにありませんので単なるコレクションという位置付けかと思います。

当方は相棒固定でレベル上げは終了してしまったので今はお土産コンプを目指してます。

"ちいさなはなたば"には感動しました。

ないと思います。
ただのコレクションですが、相棒が愛しくなります。

闥さんが回答されているとおり何ら役にたちませんが、「自分のために何か見つけて来てくれたんだ」という事で何というか健気な感じがします。

私は既にミュウツーが最高の相棒になっていて、今はルカリオを相棒にしていますが、ジム戦の時だけはミュウツーのcpブーストを利用するために相棒を切り替えていますが、その短い時間にお土産を持って来てくれた事が何度かあり、可愛さ十倍って感じです。

極度の面倒くさがりでAR嫌いの自分は、予想通り、最初の3回ぐらいだけで、あとは連れ歩がなくなりました。相棒ランクは全く上がってませんので、お土産とやらをもらったことはありません。今後、進化に必要とか、重要な意味を持たないことを祈ります。

ないと思われるソースか何かあれば教えていただけないでしょうか？理由はただただそうだとしたら残念で仕方がないというだけなのですが（汗）