ミュウツーのリトレーン

通常のミュウツーで高個体を持っているかどうかで判断したらよいと思います。リトレーンすることにより限りなく個体値100に近いものになるならば考えますね。ただし、シャドウの圧倒的な攻撃力は魅力があるので私ならシャドウのままで使用すると思います。

通常のミュウツーの良個体をお持ちならシャドウのままの活用する事をおすすめします。
もし通常ミュウツーの良個体がいなくてもシャドウミュウツーでリトレーンした場合に100%やそれに近い個体がいるなら今はリトレーンせず当面はシャドウのまま活用する事をお勧めします。
理由は通常個体よりもはるかに攻撃力が高いためです。

ただミュウツーは将来的にメガシンカが実装されます。メガミュウツーの方がシャドウよりも強くなりますので、メガシンカが実装された時点で通常ミュウツーで良個体を持っていなければリトレーンしてやれば良いと思います。

ミュウツーのリトレーンについては，明確な基準を設定しました．
1) リトレーンで100になる個体がくるまでは決してリトレーンしない．
2) リトレーンで100になる個体が来たら1体だけリトレーンする．
3) キラ100よりもリトレーン100の方を優先してカンストする．
(無課金・レイド5回/週のため，よりXL飴が節約できる方を優先)
ミュウツーのメガシンカは最後の登場になるであろうと読んでますし，妥協して98や96をリトレーンしません．しかし，リトレーン100なければキラ100でカンストはありです(砂は少なくてすむけど，XL飴が通常量なんで)．
以上のことから，質問者さんの手持ちの個体が100にならないならばひたすら100が来るまで待つことを推奨します．なお，メガシンカするには個体値100とイロチ最高個体値(殆どが98-91, ミュウツーの場合96)の2体で図鑑は完成します．なお，ジム戦ではシャドウミュウツーPL40の方がライトミュウツーPL50より強いので，リトレーンはあくまでメガシンカ用です．