バグ

一度ありましたね。再起動しても治らなかったのでおそらく仕様です。
前の回答にもあるように、ポケモンにあげる木の実の数の上限を迎えたなどと。　
もし、そのメッセージが出た後にほかのポケモンに木の実をあげられるならバグだと思います。
はあーバグ多すぎぃ
(ノ・ω・)ノオオオォォォ-
すみませんｗ

木の実を与える事ができるポケモンの数に上限があって、それ以上は上げられないのだと思います。
例えば2つのジムの全てのポケモン(全部で12体)には木の実を与える事ができません(多分10体まで)。
この制限によるものではないでしょうか？

私は特定のトレーナーのポケモンにだけ木の実をやれないという「バグ」には遭遇したことがないです。

30分間に10体までしか木の実をやれないという制限があり、それを超えてやろうとするとそのメッセージが出ますが、それと混同されていませんか？

30分以内に10体迄木の実をあげることができます。

多分、こういうことでは、

ジムAでポケ1にあげた
ジムAでポケ2にあげた
ジムAでポケ3にあげた
ジムAでポケ4にあげた
ジムAでポケ4にもう1個あげたつもりが、ポケ5にあげていた。

移動

ジムBでポケ6にあげた
ジムBでポケ7にあげた
ジムBでポケ8にあげた
ジムBでポケ9にあげた
ジムBでポケ10にあげた
ジムBでポケ11にあげた　→きのみは欲しがっていないになります。

この状態で、ポケ6～10には、木の実をあげることは可能です。
1体当たり10個まで

ジムAのポケ1にあげ終わってから、30分経過すると、ジムAのポケモンにあげて分から、順次解除されていきます。

あげながらジムを渡り歩くと、時間差で、解除された分だけが、あげることができ、それ以後は、解除時間分たつまでは、あげることができません。

私もその事象に遭いました。
バグだなと思いきのみをあげるの辞めました。

コイル警備員さん、こんにちは！

何度か同様な事になりました。
自分の端末ではまだ生存している様に見えてももうすでに落とされている状態ではないかと思います。
しばらく後に戻ってきたかと思います。

ご質問は，単にすでに10個のきのみをあげられてしまってるのではないのに，エラーメッセージが出たという意味でしょうか？そうだとしたらバグでしょうけど，少なくとも僕には出て無いですね。キノミが幾らあげられてるかチェックしてみてはいかがでしょうか。