ポケモンの選別について

進化前
１、育てたい数だけ良個体を残して、あとは全てアメにします。金銀で進化先が増えるポケモンは、余分に確保しています。
２、基本、CPの高いものしか進化しません。ポケモンによっては、個体値そこそこでも高CPで進化させる場合はあります。
３、図鑑にこだわりがないので、進化は急ぎません。

進化後
１／２／３、育てません。
４、ジム防衛に向くポケモンなら、残しておきます。入手が難しいものは、ボックスに余裕があれば残します。
５、少なくとも１体は良個体を残します。将来的に使えるようになるかもしれないので。

極論かもしれませんが、もし個体値にこだわるなら卵孵化以外では入手を望めないレア、高個体の進化元入手が困難な御三家や技構成がよくて現在ジムで使ってるのを除き、リーダーの総合評価が最高評価且つ、進化後即戦力となり得る高CPの進化元以外は、断捨離で全部アメにしてしまうのもありかと思います。

ただ技構成に優れたレアや次世代でも進化先があるポケモンなどは高個体低CPでも将来トレード実装での需要、もしくはご自身が必要になるかもしれませんので残しておいてもいいかもしれません。

私の場合
○星の砂を使ってまで強化させるのは20匹までに抑える。
○レア度が高いのは、残す。
ただし、将来のトレード機能は考えない。
○強化させる気もなく レア度が低いのは、
CPが高いの1体のみ「進化前は残さず進化後のみ」

そういう感じで150体に抑えています。
悩むくらいなら サクサク仕分けして ガンガンやった方が楽しいので‥
ゲームへのスタンスの違いなので 決して質問者への批判ではないですよ。

たくさん集めて 悩みながら選別するのも それはそれで楽しいと思いますから、

捨てられないのは、将来のことをどこまで考えるべきかわからないからですよね。

今後ありうる大きな変化としては、
①技マシンの実装
②新しいバトルコンテンツの実装
③新しいポケモン（進化先）の追加
が挙げられると思います。

このどれかが起きたときに必要かどうかで判断するといいと思います。

①②を想定して、技しだいで強いというポケモンはストックしておく価値はあるでしょう。
もし技マシンが実装されなくても、新しいバトルコンテンツでどんな技が強いかはまだわかりません。
テクニカルなバトルならばＤＰＳ計算が意味をなさない可能性もあります。
ただし全くわからないので、今のうちから育てておく必要はないでしょう。

③は、進化先がバトルで強いと予想されるポケモンは複数、それ以外は1体いればいいでしょう。
進化先のステータスは、同じ決まり方で予想をたてて一覧を載せているサイトがあります。
なおステータスは第6世代の種族値を元に決められていますが、すばやさの影響が小さく、攻撃と特攻、防御と特防は低い方のステータスの影響が大きく出る計算式となっていますので、全体として鈍足パワー型が強く、物理系と特殊系がパランスよく強いポケモンが強い傾向となっています。

①～③のどれにも該当しないポケモンは、必要となるケースがほぼ考えられないので、たとえ個体値が高くても捨ててしまっていいでしょう。

進化前
１、一番個体値が高く、ＣＰもある程度高い一体しか残していません。
２、即アメにします。育てるほど砂に余裕がありません・・・
３、入手が難しい場合は取っておきます。

進化後または、進化しないポケモン（カビゴンなど）の場合
１、三体以上になったら低いものからアメに変えて行きます。
２、育てません。砂が勿体ないです・・・
３、育てません。進化した状態で放置か、アメに変えます。
４、ベスト３を残してアメにします。
５、今はあまり活躍しないポケモンでも、将来的に進化分岐などが増えるので全て個体値の厳選はしています。


ちなみに自分のBOXは500まで拡張してありますが、125しか使っていませんでした。
沢山居ると一覧時のスクロールが面倒なので、捕まえたらすぐ個体値の評価を見てダメだったらその場で送っています。

進化前
１、飴にします。
２、個体値優先です。進化させます。
３、図鑑コンプが終わったら入手待ちの状態で残しておきます。

進化後または、進化しないポケモン（カビゴンなど）の場合
１、低個体値・CPの場合は育てません。観賞用です。
２、個体値+良技のみ育てます。
３、育てません。
４、現状は残します。今後の技補正等をみて処分検討。
５、飴にします。