ポケモンGOの回答詳細

よく使うのは、カイリュー、シャワーズ。
次にナッシー、サイドン・ゴローニャです。
ギャラドス対策に余ったサンダースを使うこともあります。

質問者様も仰られるように、カビゴンの場合、ある程度強ければどのポケモンを使っても、倒すスピードはあまり変わらない気がします。
なので、まずはタワーのカビゴン以外に合わせたポケモンをチョイスし、その中でなるべくスペックが高いもので戦うのが良いと思ってます。

それを踏まえた上で、考えると

シャワーズや胃袋カイリューは動きが軽く、避けやすい。また、カイリューは汎用性が高く、シャワーズはサイドン対策にもなるので便利です。

ナッシーは、舌舐めカビゴンでなければ、意外とおすすめです。(自分の近所では舌舐めが配置されることが少ないので)
思念のずつきと地震を軽減してくれますし、思念ソラビであれば、動きも軽く技を避けやすいです。
また、シャワーズ、サイドン(メガホーン以外)対策にもなります。

サイドン、ゴローニャは最近あまり使わなくなりました。
意外と地震もちカビゴンが配置されることが多く、たまに避けそこねてしまうので。
ジム戦が得意な方なら問題ないと思いますが、シャワーズ、カイリュー等に比べて、動きも重く感じます。
ノーマル軽減も、のしかかりの時には心強いですが、それ以外の技だとあまり恩恵を感じません。(破壊光線は避ける前提です)
カイリュー対策にはなりますが、ラプラス1匹いればカイリュー3匹抜きできるので、あまり必要性を感じません…

カイリキーは技ガチャに失敗しているのもありますが、しねんのずつきの誤爆もあるので使ってないですね…。


まとめると、
オールマイティ→カイリュー、シャワーズ(サイドン対策にもなる)
舌舐め以外→ナッシー(シャワーズ、サイドン対策にもなる)
のしかかり→サイドン・ゴローニャ

こんな感じです。
質問に対する答えになってないかもしれませんが、自分はカビゴンは時間がかかるもの、と思って諦め、他のポケモンでなるべく時間を稼ぐようにしてます。