ポケモンGOの回答詳細

CPの計算式を見れば、なぜそうなるのかが分かります。
攻撃力の種族値を「攻種」、攻撃力の個体値を「攻個」などと書くと次のとおりです。

【CPの計算式】
（攻種＋攻個）×√（防種＋防個）×√（HP種＋HP個）×（レベル係数^2）÷10
※小数点以下切捨

カイリューの種族値は
攻撃力：250、防御力：212、HP：182
Lv29.5のレベル係数は
0.725571552
ですので、よろしければ試しに電卓を叩いてみて頂ければCPと一致することが確認できるはずです。

防御力とHPはルートがかかり大きく圧縮されているのに対し、攻撃力はそのままです。
例えば「種族値＋個体値」が全て100ならば
100×10×10
になるということですので、大きな差があります。
CPの値に対しては攻撃力の影響が防御力やHPよりずっと大きいのです。

①→②は攻撃力の個体値が6下がっていますので、他が上がっていてもCP差が大きく下がります。
②→③は攻撃力の個体値は逆に上がっていますので、他が大きく下がっていてもCP差は小さくなります。

それから、「攻撃力・防御力・HP」はCPの計算をするにも実際の戦闘での強さを求める場合も足し算でなく掛け算をするものですから、「3つの個体値を足した値」というのは掛け算をした場合のだいたいの値の大きさの目安にはなっても、掛け算したら逆転する場合もあるくらいなので、正確に強さを表した値ではありません。

なお、種族値が高いほど個体値の影響は小さくなります。
個体値は絶対値でなく「種族値から何％伸びたか」が問題になります。
元々種族値が高いものが15伸びるより、低い種族値が15伸びる方が強さに大きく影響します。

また、CPの計算式は防御力とHPにルートをかけますが、実際の戦闘での強さをより正確に表すのはそれらにルートをかけずに3ステータスを同等に掛け算した値です。

総合すると、カイリューの個体値で重要なのは、
CPの大きさへの影響：攻撃力＞HP＞防御力
実際の戦闘力への影響：HP＞防御力＞攻撃力
となります。